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新技术成功地识别与脑疾病有关的难以找到的遗传突变

新技术成功地识别与脑疾病有关的难以找到的遗传突变

发布:2014年9月22日

两次接受NARSAD资助(1998年及2008年)克里斯托弗沃尔什,M.D.,Ph.D.,遗传学司司长波士顿儿童医院及其同事制定了一种新技术,以寻找疾病导致的遗传突变,这些遗传突变仅在人体细胞的一小部分中发现。这些突变被称为细胞突变;它们不是从父母继承,而是受精后发生。沃尔什博士的实验室寻求识别导致与智力残疾相关的大脑畸形的基因突变,自闭症谱系障碍和癫痫。由于使用当前遗传测序技术进行的研究仍然存在许多未解决的问题,他和他的团队旨在开发一种可以有效识别这些更难找到的体细胞突变的方法。

沃尔什博士在霍华德·休斯医学研究所(HHMI)解释说,研究人员以已知或怀疑与大脑畸形有关的基因为目标,然后试图对它们进行“一千次测序”。新闻(沃尔什医生是HHMI调查员)。典型的基因测序桑格方法,使用一种技术,即在特定的基因,如果这一策略未能确定一个突变,研究人员有时扩大搜索包括所有的蛋白质编码区域的基因组(称为外显子组),甚至进一步,整个基因组。沃尔什博士说,这些技术并非旨在发现只发生在一小部分细胞中的突变。“即使你看到的是正确的基因,你仍然可能错过突变。”

沃尔什博士和团队与158名患者的DNA合作,尽管先前的遗传测序,但仍然存在不明显的脑疾病和脑畸形。为分析,14或54个基因(根据患者的病症)的面板测序数百或数千次。在此之后,现有算法进行微调,用于搜索序列中的细胞突变;这种劳动密集型工作需要额外的几个月工作。

他们的研究结果,8月21日出版新英格兰医学杂志报告称,对于超过四分之一的患者(158条中的27个),该团队成功鉴定了可能导致疾病的突变。其中八个是体细胞突变,仅为5%至35%的测序DNA。沃尔什博士告诉HHMI新闻他的球队对已经经历了遗传测试的患者的患者发现这么多躯体突变感到惊讶。“这告诉我们,其他方法在检测躯体突变方面有多差。除非你去寻找它们,否则你不会找到这些东西 - 除非你有一个临床试验,否则设置为以敏感的方式检测它们。“

“我们认为这些躯体突变可能更为常见,因为智力残疾的原因,甚至可能比人们普遍意识到的一些精神病条件,”沃尔什博士说。“这是时候开始调查那些系统的时间。”

阅读纸质摘要。

阅读HHMI新闻中的文章。

2014年9月22日星期一

两次接受NARSAD资助(1998年及2008年)克里斯托弗沃尔什,M.D.,Ph.D.,遗传学司司长波士顿儿童医院及其同事制定了一种新技术,以寻找疾病导致的遗传突变,这些遗传突变仅在人体细胞的一小部分中发现。这些突变被称为细胞突变;它们不是从父母继承,而是受精后发生。沃尔什博士的实验室寻求识别导致与智力残疾相关的大脑畸形的基因突变,自闭症谱系障碍和癫痫。由于使用当前遗传测序技术进行的研究仍然存在许多未解决的问题,他和他的团队旨在开发一种可以有效识别这些更难找到的体细胞突变的方法。

沃尔什博士在霍华德·休斯医学研究所(HHMI)解释说,研究人员以已知或怀疑与大脑畸形有关的基因为目标,然后试图对它们进行“一千次测序”。新闻(沃尔什医生是HHMI调查员)。典型的基因测序桑格方法,使用一种技术,即在特定的基因,如果这一策略未能确定一个突变,研究人员有时扩大搜索包括所有的蛋白质编码区域的基因组(称为外显子组),甚至进一步,整个基因组。沃尔什博士说,这些技术并非旨在发现只发生在一小部分细胞中的突变。“即使你看到的是正确的基因,你仍然可能错过突变。”

沃尔什博士和团队与158名患者的DNA合作,尽管先前的遗传测序,但仍然存在不明显的脑疾病和脑畸形。为分析,14或54个基因(根据患者的病症)的面板测序数百或数千次。在此之后,现有算法进行微调,用于搜索序列中的细胞突变;这种劳动密集型工作需要额外的几个月工作。

他们的研究结果,8月21日出版新英格兰医学杂志报告称,对于超过四分之一的患者(158条中的27个),该团队成功鉴定了可能导致疾病的突变。其中八个是体细胞突变,仅为5%至35%的测序DNA。沃尔什博士告诉HHMI新闻他的球队对已经经历了遗传测试的患者的患者发现这么多躯体突变感到惊讶。“这告诉我们,其他方法在检测躯体突变方面有多差。除非你去寻找它们,否则你不会找到这些东西 - 除非你有一个临床试验,否则设置为以敏感的方式检测它们。“

“我们认为这些躯体突变可能更为常见,因为智力残疾的原因,甚至可能比人们普遍意识到的一些精神病条件,”沃尔什博士说。“这是时候开始调查那些系统的时间。”

阅读纸质摘要。

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